MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017656	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017656	GCT	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017656	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017656	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017656	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017656	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017656	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017656	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017656	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017656	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017656	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017656	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017656	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017656	CGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017656	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017656	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017656	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017656	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017656	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017656	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017656	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017656	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017656	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017656	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017656	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_017656	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017656	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017656	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017656	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017656	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017656	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017656	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017656	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017656	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017656	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017656	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017656	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017656	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017656	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017656	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017656	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017656	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017656	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017656	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017656	A	6	6	14160	14165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017656	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017656	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017656	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017656	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017656	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017656	T	6	6	15785	15790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017656	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017656	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017656	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017656	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017656	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017656	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017656	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017656	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017656	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017656	A	6	6	16040	16045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017656	ATT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017656	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017656	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017656	ATA	2	6	22442	22447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017656	A	6	6	22468	22473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017656	ATC	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017656	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017656	GTT	2	6	23072	23077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017656	ATT	2	6	23078	23083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017656	T	6	6	23100	23105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017656	TGA	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017656	ATT	2	6	23154	23159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017656	CTT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017656	AAG	2	6	23171	23176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017656	CAT	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017656	ATT	2	6	23231	23236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017656	T	6	6	23235	23240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017656	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017656	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017656	T	6	6	23297	23302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017656	TGA	2	6	24749	24754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017656	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017656	ACT	2	6	24787	24792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017656	AAG	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017656	TAA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017656	GAG	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017656	TA	3	6	24908	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017656	GT	3	6	25115	25120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017656	TC	3	6	25121	25126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017656	AGC	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017656	A	7	7	25151	25157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017656	CTT	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017656	TGC	2	6	30123	30128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017656	AGC	2	6	31590	31595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017656	T	6	6	31632	31637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017656	TCAT	2	8	32589	32596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017656	TCCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017656	TGGC	2	8	32660	32667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017656	ATG	3	9	33565	33573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017656	ATTTA	2	10	33586	33595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017656	TCT	2	6	33685	33690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017656	TGT	2	6	33696	33701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017656	TCT	2	6	33761	33766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017656	TGC	2	6	33767	33772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017656	GAT	2	6	33797	33802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017656	CATG	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017656	ATA	2	6	33846	33851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017656	A	6	6	33853	33858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017656	GCC	2	6	33901	33906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017656	TCG	2	6	33920	33925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017656	TCA	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017656	AGTG	2	8	33979	33986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017656	TGA	2	6	38456	38461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017656	T	8	8	38468	38475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017656	TGA	2	6	38512	38517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017656	AT	3	6	38569	38574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017656	GAT	2	6	39060	39065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017656	GATGC	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017656	CAG	2	6	39128	39133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017656	CGC	2	6	39152	39157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017656	GAC	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017656	A	6	6	40596	40601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017656	ATT	2	6	40623	40628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017656	GGGC	2	8	42246	42253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017656	GCG	2	6	43546	43551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017656	ATTT	2	8	46346	46353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017656	GTTT	2	8	46363	46370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017656	ATT	3	9	46394	46402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017656	ATT	2	6	46519	46524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017656	TGTTA	2	10	46533	46542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017656	A	7	7	46553	46559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017656	ACC	2	6	46748	46753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017656	ACG	2	6	46761	46766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017656	CGC	2	6	50159	50164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017656	A	6	6	50180	50185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017656	ATT	2	6	51562	51567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017656	AT	3	6	51585	51590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017656	TGTT	2	8	54057	54064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017656	GCG	2	6	54081	54086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017656	GA	3	6	54095	54100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017656	CAG	2	6	54113	54118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017656	CAT	2	6	54138	54143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017656	CGA	2	6	54156	54161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017656	T	8	8	54192	54199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017656	CAA	2	6	59700	59705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017656	CAT	2	6	62074	62079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_017656	CGGC	2	8	132050	132057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
293	NC_017656	T	6	6	132058	132063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017656	TTA	2	6	132090	132095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017656	TGT	2	6	132121	132126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_017656	CCG	2	6	132210	132215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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300	NC_017656	CGC	2	6	133710	133715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
301	NC_017656	T	8	8	133716	133723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017656	T	6	6	135784	135789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017656	T	6	6	135797	135802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_017656	A	6	6	198186	198191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_017656	ATA	2	6	201211	201216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017656	GTAGTG	2	12	203672	203683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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